리눅스 서버에서 가장 빈번히 엑세스 되는 디렉토리는
일반적으로 /usr /home 그로고 swap정도 입니다.
만약 다른 하드디스크에 격리해서 사용한다고 가정한다면
위의 디렉토리를 격리 하는게 좋은 방법일 수 있습니다.

그 외에 웹서버와 DB 서버로 사용하는 경우라면 Document
root가 있는 디렉토리와 DB가 있는 디렉토리를 격리해서
사용하는 것이 좋은 방법입니다..